يتولى قسم الشؤون الوظيفية:
1. إعداد مشاريع الاستراتيجيات والخطط والبرامج والمشاريع التنفيذية والنشاطات والدراسات لإدخال المفاهيم المعاصرة لإدارة الشؤون الوظيفية في المديرية العامة للبيئة ومتابعة حسن تنفيذها.
2. تنظيم شؤون الموظفين الذاتية والملفات الشخصية وحفظها.
3. وضع مشاريع برامج لتطوير قدرات العاملين في الوزارة والعمل على بلورتها بالتنسيق مع دائرة السياسات البيئية.